巴洛克式的入口和木质阳台使宗教裁判所宫殿成为了殖民时期的重要建筑杰作。从1610年开始，这里便是宗教法庭的对罪恶与信仰的审判所。审判官在1811年被驱逐，但1815年巴勃罗·莫里略的西班牙军队又在这里恢复了宗教审判。该法庭一直活跃到1821年。